— в ходе Отечественной войны Боровский Пафнутиев монастырь был трижды подвергнут разграблению и сожжению войсками Наполеона
— советский период оказался самым разрушительным для обители. Монастырь был закрыт и превращён в музей, ценности конфискованы и бесследно исчезли. Затем, вопреки регистрации монастыря как исторического памятника, на его территории была организована исправительно-трудовая колония
— во время Великой Отечественной войны, в период оккупации Боровска территории бывшего Пафнутиева монастыря разместились армейские части вермахта, комплекс был сильно осквернён
— после освобождения Боровска здания монастыря стали использоваться для учебных нужд: здесь была организована Школа комбайнеров. Впоследствии на территории монастыря до 1991 года находился сельхозтехникум. Здания обители ветшали
— в день памяти основателя обители с оглушительным грохотом обрушился центральный купол собора Рождества Богородицы. Под его обломками была раздавлена техника училища. После обрушения действительно была назначена авторитетная комиссия из Москвы и не быстро, но всё же началась работа по спасению монастыря
— начало работы монастырского издательства. Кроме этого, обитель имеет свою ризницу, бухгалтерию, библиотеку, иконно-книжную лавку, животноводческий комплекс
— начала свою работу детская воскресная школа
— освящены центральный престол собора Рождества Пресвятой Богородицы и монастырские пруды
— иеромонах Марк (Бойчук) положил начало строительству скита
— построен храм в ските
— масштабные работы по благоустройству территории монастыря, запущено производство сыра, начато строительство домиков «Тропос»
— начато строительство колледжа «Логос», заведено козье хозяйство
— открыт колледж «Логос» при Пафнутиевом монастыре
— открыта новая купальня на источнике преподобного Пафнутия